더 많은 양의 고순도 펩타이드를 합성할 수 있는 신속한 고처리량 병렬 펩타이드 합성 플랫폼입니다.
펩타이드 라이브러리는 단백질 기능 또는 단백질 인식을 위한 중요한 모티프를 식별하는 데 사용되는 연관된 다양한 서열의 대규모 모음입니다. 이러한 강력한 도구는 단백질체학 연구, 약물 테스트, 에피토프 식별, 효소 기질 식별, 수용체-리간드 스크리닝 등과 같은 다양한 영역에서 광범위하게 적용됩니다.
절단 라이브러리 – 절단 펩타이드 라이브러리는 활성에 필요한 가장 짧은 아미노산 서열을 식별하는 데 사용됩니다.
라이브러리는 원래 펩타이드의 측면 잔기를 체계적으로 제거하여 구성됩니다. 필수 아미노산이 알려진 경우(예: 알라닌 스캐닝에 의해), 절단 방향을 조정하여 이러한 잔기를 유지하고 반대쪽 끝에서 절단할 수 있습니다.
특별 설명
N- 및 C-말단에서 절단 단계당 제거하려는 잔류물의 수를 입력하십시오. 값이 1이면 한 번에 하나의 아미노산이 제거됩니다. 양쪽 끝에서 값 0은 시퀀스의 해당 끝을 수정합니다.
위치 라이브러리 – 위치 스캐닝은 펩타이드 서열 최적화를 위한 중요한 도구입니다.
이 라이브러리는 단일 위치에서 관심 아미노산을 식별하고 한 번에 하나씩 다른 모든 천연 아미노산으로 대체합니다. 활성의 변화는 이 위치에서 선호되는 아미노산 잔기를 식별합니다.
특별 설명
N-말단부터 계산하여 대상 서열과 치환할 아미노산의 위치를 입력하십시오. 각 위치 교체에 대해 총 20개의 시퀀스가 생성됩니다.
알라닌 스캐닝 라이브러리 – 알라닌 스캐닝은 펩타이드의 활성을 담당하는 특정 아미노산 잔기를 식별하는 접근 방식입니다.
알라닌은 각 잔기를 순차적으로 대체하는 데 사용됩니다. 필수 아미노산의 치환은 펩타이드 활성의 감소를 초래하며, 감소 정도는 치환되는 아미노산의 중요성에 대한 상대적 척도로 간주됩니다.
특별 설명
알라닌은 가장 작은 키랄 아미노산이므로 스캐닝 대체물로 가장 일반적으로 사용됩니다. 그러나, 다른 아미노산이 사용될 수도 있습니다. 대체 스캔 전략에 대한 자세한 내용은 당사에 직접 문의하십시오.
스크램블 라이브러리 – 스크램블된 라이브러리는 원래 펩타이드 시퀀스의 순열을 통해 구성됩니다.
스크램블된 라이브러리는 일반적으로 다음과 같이 사용됩니다. 1) 아미노산 구성보다 특정 서열이 활성에 중요함을 보여주는 음성 대조군; 또는 2) 무작위 선별 라이브러리를 만들어 새로운 리드를 찾기 위한 도구.
특별 설명
이 도구는 원본 시퀀스의 최대 1000개의 순열을 생성할 수 있습니다. 더 큰 세트 또는 모든 가능한 아미노산 조합 및 순열을 포함하는 모든 3-mer 또는 4-mer 펩타이드의 완전한 라이브러리의 경우 당사에 직접 문의하십시오.
중첩 라이브러리 – 중첩 펩타이드 라이브러리는 T 세포 에피토프가 본질적으로 1차 단백질 서열의 짧은 선형 펩타이드이기 때문에 T 세포 에피토프 식별에 이상적입니다.
중첩되는 펩타이드 라이브러리는 선형 또는 "연속적인" B 세포(항체 정의) 에피토프에 대한 단백질의 기본 서열을 스캔하는 데에도 적합합니다.
특별 설명
라이브러리 생성 프로세스는 2가지 매개변수로 정의됩니다: 1. 펩타이드 길이, 2. 중첩 정도를 반영하는 오프셋 수. 각 세트의 마지막 펩타이드('orphan')는 C-말단에 있기 때문에 종종 다른 펩타이드보다 짧습니다. 세트에 포함된 마지막 펩타이드는 ‘orphan’서열과 올바른 길이로 만들기 위한 하나 이상의 N-말단 잔기를 나타냅니다.
Truncation Library – Truncation peptide libraries are used to identify the shortest amino acid sequence needed for activity.
The library is constructed by systemically removing the flanking residues of the original peptide. If the essential amino acids are known (e.g., by alanine scanning), the direction of truncation can be tailored to maintain these residues and truncate from the opposite end.
Special Instructions
Enter the number of residues you wish to remove per truncation step from the N- and C-termini. A value of 1 will remove a single amino acid at a time. A value of 0 at either terminus will fix that end of the sequence.
Positional Library – Positional scanning is an important tool for peptide sequence optimization.
This library identifies an amino acid of interest at a single position and substitutes it with all other natural amino acids one at a time. Changes in activity identify the preferred amino acid residues at this position.
Special Instructions
Enter your target sequence as well as the position(s) of the amino acid to be substituted, counting from the N-terminus. A total of 20 sequences will be generated for each positional replacement.
Alanine Scanning Library – Alanine Scanning is an approach to identify specific amino acid residues responsible for a peptide’s activity.
Alanine is used to substitute each residue sequentially. Substitution of an essential amino acid results in a reduction in peptide activity, with the degree of reduction taken as a relative measure of the importance of the amino acid being substituted.
Special Instructions
Alanine is the smallest chiral amino acid and is therefore most commonly used as the scanning substitute. However, any other amino acid may be used. Please contact us directly for more information on alternate scanning strategies.
Scrambled Library – Scrambled libraries are constructed through permutation of the original peptide sequence.
Scrambled libraries are typically used as: 1) negative controls to show that a specific sequence rather than the amino acid composition is critical for activity; or 2) tools for finding new leads by creating a random screening library.
Special Instructions
This tool can generate a maximum of 1000 permutations of your original sequence. For larger sets or for complete libraries of all 3-mer or 4-mer peptides containing every possible amino acid combination and permutation, please contact us directly.
Overlapping Library – Overlapping peptide libraries are ideal for T-cell epitope identification because T cell epitopes are by their nature short linear peptides from the primary protein sequence.
Overlapping peptide libraries are also appropriate for scanning the primary sequence of proteins for linear, or "continuous", B-cell (antibody-defined) epitopes.
Special Instructions
The library generation process is defined by two parameters: peptide length and offset number which reflects the degree of overlap. The next to last peptide in each set (the 'orphan') is often shorter than the other peptides as it lies at the C-Terminus. The last peptide included in the set represents the orphan sequence plus one or more N-Terminal residues to bring it to the correct length.
